掇刀区人民法院内设立案庭、刑事审判团队、民事审判团队、行政审判(综合)团队、执行局、政治部、综合办公室、审判管理办公室、司法警察大队等9个内设机构,下辖城南法庭、城东法庭等2个基层人民法庭,担负着辖区刑事、民事案件的审理、执行工作。